Project R-13395

Ontwikkeling van multicomponent hybridisatiesensoren voor zeer selectieve detectie van nucleïnezuren (Onderzoek)

Hoge selectiviteit in de detectie van nucleïnezuren is belangrijk voor medische diagnostiek van geneesmiddelenresistente bacteriën, genetische aandoeningen en kanker, milieumonitoring en forensische toepassingen, om er maar een paar te noemen. Desondanks blijft het halen van voldoende selectiviteit en sensitiviteit in genotypering een grote technologische uitdaging. Onlangs heb ik [Brittany Mueller, University of Central Florida] een hybridisatieprobe ontwikkeld die enkelvoudige nucleotidevariaten binnen een groot temperatuurvenster kan detecteren. Deze ontwikkeling was mogelijk door toepassing van de meest recente ontwikkeling in de DNA-nanotechnologie. Belangrijk hierbij is dat de detectie met hoge selectiviteit ook kan worden bereikt met gevouwen DNA en RNA, en mogelijks met dubbelstrengs DNA. Dit is ongetwijfeld de meest selectieve probe die tot dusver is ontwikkeld. Het huidige project ambieert de selectiviteit van deze probe te combineren met expertise aan de UHasselt over het gebruik van een referentieprobe en target depletie om de sensitiviteit te verhogen. Dit is belangrijk o.a. in het kader van een vroege kankerdiagnose. Analyse van celvrij circulerend tumor DNA (ctDNA) in plasma is een belangrijke niet-invasieve methode geworden voor de detectie van tumor-afgeleide nucleïnezuren. De beschikbare methoden zijn echter onvoldoende gevoelig, aangezien het otale celvrije DNA in bloed slechts voor enkele procenten uit ctDNA bestaat.

01 januari 2023 - 31 december 2024